花蓮縣的面積雖為台灣各縣之冠，但為多山地形，平原僅佔全縣面積的10％。多數人口集中在平原一帶。花蓮縣的平原地帶並非直接面向海洋，而是夾在東側海岸山脈與西側的中央山脈之間，寬度僅有3到9公里，稱為花東縱谷。

中央山脈高於3000公尺以上，列入「台灣百岳」的山峰，在花蓮縣就有43座，最著名的有南湖大山、奇萊山、秀姑巒山等。花蓮東海岸線長有124公里，由於有多條河流出海，造成豐富的海岸景觀，特別是和平溪口南邊的清水斷崖，高1000公尺以上，斷崖峭壁，景觀險峻，是蘇花公路上的知名景點。